MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Lorraine plasmid pLELO

Total Repeats: 428

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018141	T	7	7	1	7	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018141	A	7	7	67	73	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018141	A	6	6	2418	2423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018141	T	6	6	4476	4481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018141	GTT	2	6	4522	4527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018141	A	7	7	4567	4573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018141	ATC	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018141	TTCT	2	8	4644	4651	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018141	ATT	2	6	4684	4689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018141	TAA	2	6	4690	4695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018141	TAAA	2	8	5801	5808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018141	GCAAAA	2	12	5822	5833	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018141	TAG	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018141	ACA	2	6	6350	6355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018141	AAGAA	2	10	6371	6380	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018141	TGAA	2	8	6398	6405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018141	TAA	2	6	6946	6951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018141	TTA	2	6	10180	10185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018141	A	7	7	10185	10191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018141	TA	3	6	10215	10220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018141	TAT	2	6	10227	10232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018141	GGA	2	6	10266	10271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018141	A	6	6	11876	11881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018141	TAC	2	6	11891	11896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018141	GTTTT	2	10	12417	12426	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018141	T	7	7	12423	12429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018141	TGA	2	6	12476	12481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018141	TAA	2	6	14585	14590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018141	ACT	2	6	15499	15504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018141	TGTTC	2	10	20073	20082	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018141	TCT	2	6	20572	20577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018141	AGTGG	2	10	21943	21952	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018141	TGATTT	2	12	21960	21971	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018141	ATA	2	6	21993	21998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018141	AAAC	2	8	22045	22052	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018141	T	7	7	22055	22061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018141	ATC	2	6	22113	22118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018141	TTATC	2	10	25811	25820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018141	GAA	2	6	25849	25854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018141	A	7	7	25853	25859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018141	AATT	2	8	25878	25885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018141	TTAGA	2	10	25892	25901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018141	ATA	2	6	25902	25907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018141	ATT	2	6	25969	25974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018141	CAT	2	6	25976	25981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018141	T	6	6	28848	28853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018141	CAT	2	6	28908	28913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018141	CTG	2	6	29611	29616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018141	AGT	2	6	29629	29634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018141	TAA	2	6	29657	29662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018141	GCT	2	6	29663	29668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018141	TAT	2	6	29669	29674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018141	ATT	2	6	29676	29681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018141	A	6	6	30705	30710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018141	CTTA	2	8	30730	30737	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018141	A	6	6	30742	30747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018141	A	6	6	30785	30790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018141	AATAG	2	10	30800	30809	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018141	AAT	2	6	30824	30829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018141	GTG	2	6	31122	31127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018141	AAT	2	6	31150	31155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018141	ACA	2	6	31173	31178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018141	GAA	2	6	31297	31302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018141	CAG	2	6	31313	31318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018141	CCA	2	6	31346	31351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018141	TAT	2	6	31366	31371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018141	AAG	2	6	31383	31388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018141	TAT	2	6	32124	32129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018141	ATA	2	6	35606	35611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018141	TA	4	8	35645	35652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018141	AT	3	6	35710	35715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018141	TGG	2	6	35802	35807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018141	CT	3	6	36546	36551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018141	AC	3	6	36615	36620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018141	TA	3	6	36638	36643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018141	TA	4	8	38047	38054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018141	T	7	7	38063	38069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018141	TAA	2	6	38079	38084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018141	TTAT	2	8	39248	39255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018141	CAA	2	6	40329	40334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018141	AATG	2	8	40338	40345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018141	TCTTA	2	10	40403	40412	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018141	GGT	2	6	40415	40420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018141	ATTT	2	8	40443	40450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018141	AAAAG	2	10	40477	40486	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018141	TAT	2	6	41158	41163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018141	TTCA	2	8	41174	41181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018141	ATC	2	6	41216	41221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018141	TA	3	6	41478	41483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018141	A	6	6	41483	41488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018141	A	6	6	41499	41504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018141	ATTTT	2	10	41520	41529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018141	TAG	2	6	41550	41555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018141	TCA	2	6	41660	41665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018141	AT	3	6	41688	41693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018141	ATT	2	6	41771	41776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018141	TGAG	2	8	41790	41797	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018141	A	6	6	41798	41803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018141	ATT	2	6	41809	41814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018141	AT	3	6	41830	41835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018141	TAA	2	6	41842	41847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018141	GAAAA	2	10	41857	41866	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018141	TTCC	2	8	42519	42526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018141	GAA	2	6	42546	42551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018141	A	6	6	42633	42638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018141	A	6	6	42654	42659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018141	GA	3	6	42665	42670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018141	AAG	2	6	42726	42731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018141	AAT	2	6	42749	42754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018141	A	6	6	42769	42774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018141	TAG	2	6	42797	42802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018141	ACC	2	6	43324	43329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018141	GA	3	6	43336	43341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018141	A	7	7	43341	43347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018141	TATTAA	2	12	43354	43365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018141	TTAA	2	8	43377	43384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018141	GTA	2	6	43448	43453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018141	ATT	2	6	43538	43543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018141	ATA	2	6	43592	43597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018141	GC	3	6	43598	43603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018141	TATC	2	8	43608	43615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018141	T	6	6	43741	43746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018141	AGTA	2	8	43747	43754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018141	TCA	2	6	43760	43765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018141	AGA	2	6	46224	46229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018141	ATG	2	6	46267	46272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018141	TAT	2	6	46311	46316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018141	TTTC	2	8	46348	46355	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018141	ATTG	2	8	47554	47561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018141	AAC	2	6	50859	50864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018141	CAT	2	6	50870	50875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018141	CTG	2	6	50908	50913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018141	CTA	2	6	53306	53311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018141	TAG	2	6	53318	53323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018141	TAC	2	6	53325	53330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018141	TAG	2	6	53339	53344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018141	GAAA	2	8	53360	53367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018141	TTG	2	6	53374	53379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018141	TTTA	2	8	53384	53391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018141	TGG	2	6	53482	53487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018141	ATA	2	6	56637	56642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018141	AAGT	2	8	56648	56655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018141	T	7	7	56696	56702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018141	AGA	2	6	56754	56759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018141	CCT	2	6	57781	57786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_018141	AT	3	6	57803	57808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018141	T	6	6	57830	57835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018141	A	6	6	65140	65145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018141	CAA	2	6	65154	65159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_018141	A	6	6	65347	65352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018141	GAA	2	6	65398	65403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_018141	CTT	2	6	67367	67372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_018141	TA	3	6	81705	81710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_018141	TAA	2	6	81832	81837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_018141	GTAA	2	8	100667	100674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
285	NC_018141	A	6	6	100673	100678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_018141	TTG	2	6	100715	100720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018141	A	6	6	100874	100879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018141	GAA	2	6	100921	100926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018141	CAAA	2	8	100948	100955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
290	NC_018141	GCA	2	6	100981	100986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_018141	TGC	2	6	101079	101084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_018141	AGG	2	6	101188	101193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
295	NC_018141	AAAG	2	8	101236	101243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
296	NC_018141	A	6	6	101285	101290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_018141	A	7	7	101418	101424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_018141	AGC	2	6	102743	102748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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331	NC_018141	AAC	2	6	110395	110400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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342	NC_018141	T	6	6	112505	112510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_018141	ATT	2	6	113132	113137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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347	NC_018141	A	6	6	113218	113223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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352	NC_018141	A	6	6	113404	113409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_018141	TAC	2	6	150289	150294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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422	NC_018141	AAAT	2	8	150329	150336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_018141	TGA	2	6	150392	150397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_018141	AGA	2	6	150408	150413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
427	NC_018141	A	6	6	150413	150418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_018141	AT	4	8	150420	150427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.